La amnesia no es realmente un síntoma común de la migraña. Existe una entidad denominada “migraña confusional” cuando los individuos pueden tener algún deterioro de la orientación durante su ataque de migraña y pueden tener dificultades con el recuerdo de los acontecimientos, después de que el ataque ha terminado. La amnesia global transitoria (TGA) es una condición diferente. Los mecanismos exactos cerebrales que causan TGA todavía no están totalmente aclarados.

La amnesia global transitoria es una condición caracterizada por una pérdida temporal de la memoria anterógrada que ahorra memoria inmediata y remota, es decir, los recuerdos más antiguos. La causa de la TGA se debate. La migraña es reportada por algunos autores como un factor de riesgo en individuos que tienen episodios de TGA, pero la migraña no necesariamente es su causa.

Normalmente un ataque de TGA durará varias horas. Una persona que sufre de TGA suele ser capaz de llevar a cabo en su día a día sus funciones con normalidad, por ejemplo conducir o tocar instrumentos, pero a menudo puede pedir que le repitan las preguntas de los que les rodean y dejar de retener cualquier nueva información durante su ataque TGA, es decir, un fracaso para crear y/o almacenar nuevos recuerdos. No tienen idea de que algo anda mal en el ataque TGA ni tienen un recuerdo del ataque TGA después de que este haya terminado. Un ataque de TGA generalmente se presenta sólo una vez y no se considera una forma de epilepsia. Algunas personas lo han asociado con dolor de cabeza.